通过RNA-seq分析帕博西尼抗性TNBC的差异基因表达

　　目的：由于缺乏有效的靶向治疗，三阴性乳腺癌 (TNBC) 的管理仍然是一项重大的临床挑战。细胞周期蛋白依赖性激酶 4 和 6 (CDK4/6) 的抑制剂正在成为有希望的 TNBC 治疗剂;然而，细胞可以通过多种尚未确定的机制迅速获得抵抗力。因此，确定对 CDK4/6 抑制耐药的潜在机制对于开发可以扩展 CDK4/6 抑制剂疗效或延迟耐药的联合疗法至关重要。本研究旨在鉴定与 ER 乳腺癌细胞中对帕博西尼 获得性耐药相关的差异表达基因 (DEG)。

　　方法：我们在 ER-MDA-MB-231帕博西尼敏感 (231/pS) 和帕博西尼抗性 (231/pR) 细胞中进行了下一代转录组测序 (RNA-seq) 和通路分析。

　　结果：与 231/pS 细胞相比，我们在 231/pR 中鉴定了 2247 个上调和 1427 个下调的转录本。使用基因本体论 (GO) 和 KEGG 数据库对 DEG 进行功能分析，该数据库确定了许多与乳腺癌相关的转导通路，包括 PI3K/AKT、PTEN 和 mTOR 通路。此外，Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 显示对帕博西尼的耐药性与胆固醇和脂肪酸生物合成的改变密切相关，这表明对帕博西尼的耐药性可能依赖于脂质代谢重编程。

　　结论：本研究提供的证据表明，在对帕博西尼具有获得性耐药的 TNBC 中，脂质代谢发生了改变。需要进一步的研究来确定观察到的脂质代谢重新布线是否可以用来克服 TNBC 的治疗耐药性。